AMDAグループとは、「特定非営利活動法人AMDA」のほかに「AMDA International」「特定非営利活動法人AMDA社会開発機構」「特定非営利活動法人AMDA国際医療情報センター」「アムダ国際福祉事業団」「AMDA兵庫」を含めた6団体およびAMDA国内支部、クラブから成ります。
それぞれの団体、支部、クラブは独立した会計で運営されています。
AMDA国内支部はAMDA沖縄支部、AMDA神奈川支部があります。
また国内クラブは、AMDAの活動を支えるボランティア組織としての位置づけであり、 AMDA高知クラブ、AMDA福山クラブ、AMDA大槌クラブ、AMDA神女クラブ、AMDA竹原クラブがあります。
その他にも、中学生・高校生を中心とした学生で構成されるAMDA中学高校生会があります。